分为五个阶段：

第一阶段为准备阶段。主要工作是研读技术导则、相关技术规范，确定总体思路和技术路线。

第二阶段为开展调查工作阶段。主要工作是收集资料、实地勘查、数据信息的整理和汇总、集成格式规范统一的数据集和图集。

第三阶段为数据分析阶段。根据调查数据，分析县域矿山生态环境现状、生态环境问题，对县域矿山生态环境进行评估。

第四阶段为报告编制阶段。根据调查结果和数据分析，编制县域生态环境详细调查报告。

第五阶段为成果提交阶段，提交数据集、照片集、图片集及报告，并按规定格式命名、编号，按统一版本进行整理上交。

整个调查过程中，应与相关管理部门、矿企等机构进行有效的沟通，尤其应将调查结果（含阶段性成果）及时汇总分析核查以便及时修正、跟进，以保证矿山生态环境详细调查的高效性和科学性。

矿山生态环境详细调查工作流程图见图1。